OXFORD NANOPORE
TECHNOLOGIES
Oxford Nanopore Technologies está detrás del único secuenciador de ADN/ARN portátil en tiempo real del mundo, el MinION™. Al ampliarse a los sistemas PromethION™ y GridION™, la tecnología de nanoporos puede proporcionar flujos de trabajo de análisis molecular en tiempo real para cualquier proyecto, ya sea personal o poblacional. El análisis de nanoporos proporciona secuenciación de lectura ultralarga, directa, bajo demanda y en tiempo real. La tecnología se puede utilizar en una variedad de áreas de investigación científica, incluidos patógenos y resistencia a antimicrobianos, genética humana, investigación de plantas/cultivos e investigación ambiental. Biosystems Corp y Oxford Nanopore, ofrecen soluciones integrales para mercados aplicados que incluyen atención médica/detección, pruebas en alimentos, investigación ambiental y genética, entre otras. Áreas de investigación
PRODUCTOS
Su secuenciador de ADN y ARN personal y portátil. Obtenga control total y creatividad sobre cuándo, dónde y con qué frecuencia secuencia.
MinION Mk1B proporciona el poder de la secuenciación con nanoporos en un dispositivo accesible y completamente portátil. Con un peso de solo 100 g y funcionando desde una computadora portátil, MinION Mk1B genera decenas de gigabases de datos en tiempo real, ya sea en el campo o en el laboratorio.
Secuenciador de nanoporos de sobremesa autónomo y fácilmente desplegable. Un secuenciador de nanoporos flexible, autónomo y de sobremesa, que ejecuta hasta cinco celdas de flujo MinION o Flongle (o combinaciones de ellas) que puede responder a las necesidades de múltiples usuarios bajo demanda, a través de variadas aplicaciones. El procesamiento de datos integrado de alto rendimiento alivia la necesidad de una infraestructura informática compleja.
Secuenciadores de nanoporos flexibles de alto rendimiento para ADN/ARN. Ofreciendo la flexibilidad de 24 celdas de flujo de alto rendimiento controlables de forma independiente y aprovechando algoritmos de vanguardia y tecnología GPU, el PromethION 24 (P24) proporciona a usuarios individuales o múltiples acceso bajo demanda a terabases de datos de secuenciación. El PromethION 48 (P48), nuestro dispositivo de secuenciación más potente, ofrece el doble de capacidad y rendimiento que el P24, ideal para proyectos de secuenciación a gran escala y de producción.
Secuenciadores de nanoporos flexibles de alto rendimiento para ADN/ARN. Ofreciendo la flexibilidad de 24 celdas de flujo de alto rendimiento controlables de forma independiente y aprovechando algoritmos de vanguardia y tecnología GPU, el PromethION 24 (P24) proporciona a usuarios individuales o múltiples acceso bajo demanda a terabases de datos de secuenciación. El PromethION 48 (P48), nuestro dispositivo de secuenciación más potente, ofrece el doble de capacidad y rendimiento que el P24, ideal para proyectos de secuenciación a gran escala y de producción.
Acceso de bajo costo a la secuenciación PromethION de alto rendimiento. Ofreciendo la flexibilidad de dos celdas de flujo PromethION independientes de alto rendimiento, los compactos dispositivos PromethION 2 brindan los beneficios de la secuenciación de nanoporos de alta cobertura a usuarios con requisitos menores de procesamiento de muestras. Obtén secuenciación y análisis completamente integrados con PromethION 2 Integrated, o utilce su infraestructura informática GridION con PromethION 2 Solo.
Acceso de bajo costo a la secuenciación PromethION de alto rendimiento. Ofreciendo la flexibilidad de dos celdas de flujo PromethION independientes de alto rendimiento, los compactos dispositivos PromethION 2 brindan los beneficios de la secuenciación de nanoporos de alta cobertura a usuarios con requisitos menores de procesamiento de muestras. Obtén secuenciación y análisis completamente integrados con PromethION 2 Integrated, o utilce su infraestructura informática GridION con PromethION 2 Solo.
Flongle adapter es un dispositivo adicional para MinION o GridION que permite la secuenciación directa de ADN o ARN en tiempo real, utilizando celdas de flujo más pequeñas y de un solo uso. Entrega hasta 2.8 Gb de datos. Proporcionando acceso inmediato a los datos de secuencia, Flongle está diseñado para ser el sistema de secuenciación más rápido, accesible y rentable para pruebas o experimentos más pequeños o que se realizan con mayor frecuencia. Las celdas de flujo de Flongle deben usarse dentro de las cuatro semanas posteriores a su recepción.
MinION GridION Flow Cell R10.4.1 version
La celda de flujo MinION (R10.4.1) es un consumible que se utiliza con los dispositivos MinION y GridION. Contiene el conjunto de sensores patentado, el circuito integrado de aplicación específica (ASIC) y los nanoporos R10.
La serie R10 de nanoporos contiene un cabezal de lectura doble y es adecuada para experimentos donde se requiere una alta precisión de consenso. Emparejado con la química Kit 14, R10.4.1 genera datos con una precisión modal superior al 99%.
Esta versión es compatible con los kits V14 lanzados recientemente, incluido el kit de secuenciación por ligación V14, el kit de secuenciación rápida V14 y barcording.
MinION or GridION Flow Cell RNA
Una celda de flujo MinION/GridION RNA es un consumible utilizado con los dispositivos MinION y GridION. Contiene la matriz de sensores propietaria, el circuito integrado para aplicaciones específicas (ASIC) y nanoporos. Esta es nuestra celda de flujo específica para ARN, y junto con el Kit de Secuenciación Directa de ARN (SQK-RNA004), genera una precisión y salida de secuenciación mejoradas para las librerías de ARN.
Actualmente, esta versión solo es compatible con nuestro Kit de Secuenciación Directa de ARN (SQK-RNA004).
PromethION Flow Cell R10.4.1 (M version)
Una celda de flujo PromethION (R10.4.1) es un consumible utilizado con dispositivos PromethION 2 Solo, P24 y P48. Contiene la matriz de sensores propietaria, el circuito integrado para aplicaciones específicas (ASIC) y nanoporos R10. La serie R10 de nanoporos contiene un cabezal de lectura doble y es adecuada para experimentos donde se requiere una alta precisión de consenso. Emparejado con la química Kit 14, R10.4.1 genera datos con una precisión modal superior al 99%.
Esta versión es compatible con los kits V14 lanzados recientemente, incluido el kit de secuenciación por ligación V14, el kit de secuenciación rápida V14 y barcording.
Una celda de flujo PromethION RNA es un consumible utilizado con dispositivos PromethION 2 Solo, P24 y P48. Contiene el conjunto de sensores patentado, el Circuito Integrado para Aplicaciones Específicas (ASIC) y nanoporos. Esta es nuestra celda de flujo específica para ARN y, junto con el Kit de Secuenciación Directa de ARN (SQK-RNA004), se genera una precisión de secuenciación y un rendimiento mejorados para las librerías de ARN.
Esta versión actualmente solo es compatible con el Kit de Secuenciación Directa de ARN (SQK-RNA004).
Flongle Flow Cell R10.4.1 Version
Una celda de flujo Flongle (R10.4.1) es un consumible utilizado con el adaptador Flongle y los dispositivos MinION y GridION.Contiene el conjunto de sensores patentado y los nanoporos R10.4.1 adecuados para todos los kits V14 que utilizan la química Kit 14.
Esta versión es compatible con los kits V14 lanzados recientemente, incluido el kit de secuenciación por ligación V14, el kit de secuenciación rápida V14 y barcording.
Este kit contiene seis viales de ADN Lambda para realizar un experimento de control Lambda. El ADN Lambda tiene una longitud de 48 kb y sirve como un buen sistema modelo para evaluar el flujo de trabajo de secuenciación nanopore. Los experimentos de control deben llevarse a cabo cuando los usuarios están empezando con un dispositivo Oxford Nanopore, o cuando se solucionan problemas en la preparación de bibliotecas.
El PCR Barcoding Expansion 1-12 está diseñado para permitir la agrupación y el funcionamiento conjunto de múltiples bibliotecas de secuenciación en los dispositivos de secuenciación Oxford Nanopore. El kit incluye adaptadores y primers para PCR Fw y RV. Hay 12 códigos de barras únicos y suficientes adaptadores para hacer 6 bibliotecas por código de barras. Los códigos de barras han sido cuidadosamente diseñados y ampliamente purificados para minimizar la posibilidad de cruce. Actualmente existen dos protocolos para este kit, que se proporcionan como ejemplos de cómo podría aplicarse la PCR Barcoding Expansion 1-12 para bibliotecas genómicas y de amplicones. Por favor, tenga en cuenta que si está codificando ADNc o amplicones, estos tienen que ser preparados previamente. Estos protocolos están abiertos a la adaptación y optimización para requisitos experimentales específicos. Tenga en cuenta que para utilizar este kit, necesitará adquirir reactivos adicionales de terceros.
El PCR Barcoding Expansion 1-96 (EXP-PBC096) está diseñado para permitir la agrupación y el funcionamiento conjunto de múltiples bibliotecas de secuenciación. El kit incluye adaptadores y cebadores de PCR RV y FW con el mismo código de barras en ambos cebadores. El kit contiene 96 códigos de barras únicos. Hay 96 códigos de barras únicos y suficientes de los adaptadores necesarios para hacer 10 bibliotecas por código de barras. Los códigos de barras han sido cuidadosamente diseñados y ampliamente purificados para minimizar la posibilidad de interferencia. Actualmente existen dos protocolos para este kit que se proporcionan como ejemplos de cómo podría aplicarse la PCR Barcoding Expansion 1-96 para bibliotecas genómicas y de amplicones. Por favor, tenga en cuenta que si está codificando ADNc o amplicones, estos tienen que ser preparados previamente. Estos protocolos están abiertos a la adaptación y optimización para requisitos experimentales específicos. Tenga en cuenta que para utilizar este kit, necesitará adquirir reactivos adicionales de terceros.
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen lavar células de flujo y volver a ejecutar con muestras frescas.
-Deseen procesar muestras a demanda, en lugar de procesarlas por lotes.
-Han acumulado un gran número de poros «no disponibles» durante una ejecución anterior y desean revertir estos poros al estado de «poro único».
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen lavar células de flujo y volver a ejecutar con muestras frescas.
-Deseen procesar muestras a demanda, en lugar de procesarlas por lotes.
-Han acumulado un gran número de poros «no disponibles» durante una ejecución anterior y desean revertir estos poros al estado de «poro único».
El Native Barcoding Auxiliary V14 Kit (EXP-NBA114) contiene reactivos adicionales de preparación de bibliotecas para el Native Barcoding Kit 24 y 96 V14 (SQK-NBD114.24 y SQK-NBD114.96), y el Multiplex Ligation Sequencing Kit XL V14 (SQK-MLK114.96-XL), para otras 12 reacciones. De este modo, los usuarios pueden utilizar los códigos de barras no utilizados en sus kits de código de barras nativo.
Este kit contiene primers de PCR y adaptadores y es compatible para su uso con los kits de secuenciación de ligación (SQK-LSK110 y SQK-LSK109).
Este kit se recomienda para usuarios que:
-Deseen dividir una biblioteca en varias celdas de flujo
-Necesiten añadir una nueva biblioteca a una celda de flujo lavada
-Deseen rellenar una celda de flujo con una biblioteca adicional.
Este kit se recomienda para usuarios que:
-Quieren seleccionar por tamaño para eliminar progresivamente los fragmentos cortos (<25 kb) de su muestra
-Deseen enriquecer sus bibliotecas en busca de fragmentos largos sin utilizar reactivos externos de terceros
El Short Fragment Eliminator(EXP-SFE001) es un nuevo paquete de expansión recomendado para usuarios que deseen seleccionar por tamaño ADNg de alto peso molecular (HMW) para eliminar fragmentos cortos (<25 kb) mediante precipitación selectiva por tamaño. El kit contiene el tampón Short Fragment Eliminator (SFE) que elimina progresivamente los fragmentos de hasta 25 kb, eliminando casi por completo los fragmentos de menos de 10 kb en un flujo de trabajo rápido y sencillo.
El SFB Expansion kit contiene buffer de fragmentos cortos (SFB) adicional para su uso con experimentos de secuenciación en los que se requieren fragmentos cortos o para su uso con el protocolo «PCR tiling of COVID-19 virus».
El LFB expansion kit contiene tampón de fragmentos largos (LFB) adicional para su uso con experimentos de secuenciación en los que se deben eliminar fragmentos más cortos (<3 kb).
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen secuenciar el genoma completo del SARS-CoV-2.
-Deseen multiplexar muestras para reducir el precio por muestra.
El Midnight RT PCR Expansion (EXP-MRT001) está diseñado para ser utilizado con el Rapid Barcoding Kit 96 (SQK-RBK110.96) o el Rapid Barcoding Kit 96 V14 (SQK-RBK114.96) y proporciona todos los reactivos necesarios para el flujo de trabajo completo para secuenciar muestras de ARN de SARS-CoV-2.
El RNA Control Expansion contiene muestras de control de ARN para realizar pruebas de control de los kits de secuenciación de ADNc.
La expansión Rapid Adapter Auxiliary V14 (EXP-RAA114) contiene adaptador rápido y buffer de adaptador adicionales para otras seis reacciones. Esto permite a los usuarios utilizar cualquier código de barras no utilizado en sus Rapid Barcoding Kits V14.
Para utilizar este kit, asegúrese de adquirir los viales auxiliares de secuenciación V14 (EXP-AUX003) para obtener los reactivos de priming de la celda de flujo. El Rapid Adapter Auxiliary V14 (EXP-RAA114) sólo puede utilizarse con kis de química 14. Este kit NO es compatible con otros kits basados en químicas anteriores.
Esta ampliación está recomendada para usuarios que:
-Deseen realizar cargas adicionales de celdas de flujo a partir de preparaciones de bibliotecas ultralargas existentes.
-Los Ultra-Long Auxiliary Vials (EXP-ULA001) contienen reactivos suficientes para 12 reacciones adicionales.
El EEB expansion contiene reactivos adicionales para su uso con el kit de secuenciación de ADN ultralargo V14 (SQK-ULK114).
El Flow Cell Priming Kit contiene reactivos de priming de celdas de flujo adicionales para seis reacciones utilizando los kits V14.
El kit puede utilizarse para imprimar celdas de flujo MinION y GridION o PromethION para secuenciación o para recargar más bibliotecas en una celda de flujo durante un experimento de secuenciación.
Nota: Sólo es compatible con la química V14.
El Flow Cell Priming Kit contiene reactivos de priming de celdas de flujo adicionales para seis reacciones utilizando los kits V14.
El kit puede utilizarse para imprimar celdas de flujo MinION y GridION o PromethION para secuenciación o para recargar más bibliotecas en una celda de flujo durante un experimento de secuenciación.
Nota: Sólo es compatible con la química V14.
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen obtener una precisión de lectura bruta modal de Q20+ (99%) y superior
-Deseen obtener datos dúplex
-Deseen optimizar su experimento de secuenciación en cuanto a precisión y rendimiento
-Necesitan controlar la longitud de las lecturas
-Desean utilizar procesos previos como la selección por tamaño o la amplificación del genoma completo.
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, necesitará adquirir reactivos adicionales de terceros.
Ligation Sequencing Kit XL V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen obtener una precisión de lectura bruta modal de Q20+ (99%) y superior
-Deseen obtener datos dúplex
-Deseen optimizar su experimento de secuenciación en cuanto a precisión y rendimiento
-Necesitan controlar la longitud de las lecturas
-Desean utilizar procesos previos como la selección por tamaño o la amplificación del genoma completo.
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, necesitará adquirir reactivos adicionales de terceros.
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen multiplexar hasta 24 muestras para reducir el precio por muestra
-Deseen alcanzar una precisión de lectura bruta modal de Q20+ (99%) y superior
-Deseen obtener datos dúplex
-Deseen optimizar su experimento de secuenciación en cuanto a precisión y rendimiento
-Necesitan un método de multiplexación sin PCR para conservar información adicional como las modificaciones de bases
-Necesitan controlar la longitud de la lectura
-Desean utilizar procesos previos como la selección por tamaño o la amplificación del genoma completo
Tenga en cuenta que, para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros.
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen multiplexar hasta 24 muestras para reducir el precio por muestra
-Deseen alcanzar una precisión de lectura bruta modal de Q20+ (99%) y superior
-Deseen obtener datos dúplex
-Deseen optimizar su experimento de secuenciación en cuanto a precisión y rendimiento
-Necesitan un método de multiplexación sin PCR para conservar información adicional como las modificaciones de bases
-Necesitan controlar la longitud de la lectura
-Desean utilizar procesos previos como la selección por tamaño o la amplificación del genoma completo
Tenga en cuenta que, para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros.
Multiplex Ligation Sequencing Kit XL V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen optimizar el rendimiento de su experimento de secuenciación
-Deseen muestras de bajo multiplexado para la secuenciación del genoma completo (WGS)
-Necesiten un método de multiplexación sin PCR para conservar información adicional, como modificaciones de bases
-Necesidad de controlar la longitud de las lecturas
-Desea utilizar procesos previos, como la selección por tamaño o la amplificación del genoma completo
-Desearía procesar múltiples muestras simultáneamente, ya sea con una pipeta multicanal
Tenga en cuenta que, para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros.
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Requieran poco tiempo de preparación
-Tengan acceso limitado a equipos de laboratorio
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Rapid PCR Barcoding Kit 24 V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen multiplexar hasta 24 muestras para reducir el precio por muestra
-Dispongan de una cantidad inicial baja de ADNg
-Requieran un procedimiento sencillo de preparación de bibliotecas
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen realizar secuenciación 16S
-Estén interesados en la identificación de bacterias a nivel de género
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Dispongan de una cantidad limitada de material de entrada
-Deseen multiplexar muestras para reducir el precio por muestra
-Deseen optimizar el rendimiento de su experimento de secuenciación
-Deseen identificar y cuantificar transcritos de longitud completa
-Estén interesados en la expresión génica diferencial
-Desean caracterizar y cuantificar isoformas, variantes de empalme y transcritos de fusión
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Dispongan de una cantidad limitada de material de entrada
-Deseen optimizar el resultado de su experimento de secuenciación
-Deseen identificar y cuantificar transcritos de longitud completa
-Estén interesados en la expresión génica diferencial
-Deseen caracterizar y cuantificar isoformas, variantes de empalme y transcritos de fusión
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen eliminar el sesgo de la PCR
-Exploren los atributos del ARN nativo, como las bases modificadas.
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Rapid barcoding sequencing kit 24 V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen multiplexar hasta 24 muestras para reducir el precio por muestra
-Requieran un tiempo de preparación corto
-Necesiten un método de multiplexación sin PCR para conservar información adicional, como modificaciones de bases
-Tengan acceso limitado a equipos de laboratorio
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Rapid barcoding sequencing kit 96 V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Deseen multiplexar hasta 96 muestras para reducir el precio por muestra
-Requieran un tiempo de preparación corto
-Necesiten un método de multiplexación sin PCR para conservar información adicional, como modificaciones de bases
-Tengan acceso limitado a equipos de laboratorio
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros
Ultra-Long DNA Sequencing Kit V14
Este kit está recomendado para usuarios que:
-Trabajen con ADN de peso molecular ultraelevado y deseen longitudes de lectura con un N50 >50 kb.
-Requieran un flujo de trabajo de extremo a extremo para secuenciar ADN de peso molecular ultraelevado
Tenga en cuenta que para utilizar este kit, deberá adquirir reactivos adicionales de terceros